El concepto más importante a entender es el sistema de paquetes Debian. Esencialmente, podría considerarse que gran parte de su sistema está bajo el control del sistema de paquetes. Esto incluye:

Por ejemplo, si sustituye /usr/bin/perl, éste funcionará, pero si luego actualiza su paquete perl, el fichero que puso en su lugar será sustituido. Los usuarios avanzados pueden evitar esto poniendo los paquetes en estado «hold» (congelado) en aptitude.

Uno de los mejores métodos de instalación es apt. Puede usar la versión de línea de órdenes apt-get o la versión de interfaz a pantalla completa aptitude. Note que apt también le permitirá combinar «main», «contrib» y «non-free», de este modo puede tener paquetes con restricción de exportación así como las versiones estándares.

Las versiones alternativas de aplicaciones son manejadas por «update-alternatives», Si mantiene múltiples versiones de sus aplicaciones, lea la página de manual de «update-alternatives».

Cualquier tarea bajo supervisión del administrador del sistema debe estar en /etc, puesto que estos son ficheros de configuración. Si tiene una tarea de cron de superusuario que se ejecuta diariamente, semanalmente o cada noche, colóquela en /etc/cron.{daily,weekly,monthly}. Estos se invocan desde /etc/crontab y se ejecutarán en orden alfabético, lo cual serializa el procesamiento.

Por otro lado, si tiene una tarea de cron que (a) necesita ejecutarse como un usuario específico o (b) necesita ejecutarse en un momento o frecuencia especifica, puede usar tanto /etc/crontab como /etc/cron.d/cualquiercosa. Estos ficheros específicos también tienen un campo adicional que le permite definir el usuario bajo el cual se ejecuta la tarea.

En cualquier caso, simplemente edite los ficheros y cron notará el cambio automáticamente. No hay necesidad de ejecutar una orden especial. Para más información vea cron(8), crontab(5) y /usr/share/doc/cron/README.Debian.